Cecilia, Leo, Une og Egon drar for å utforske den gamle Gibsongruven som ligger i fjellsiden bak Perlen pensjonat. Gruven har ikke vært i bruk på lang tid. De finner spor etter den store gruveulykken, svartkrutt og kasser med gamle dynamittgubber. Men dypt inne i de mørke gruvegangene gjør de også oppdagelser som tyder på at den gamle gruven skjuler hemmeligheter som ikke tåler dagens lys. De tre fatter mistanke om at det som skjer langt inne i fjellet har noe å gjøre med dykkerskipet som ligger i Skutebukta. Det er leid inn for å lete etter frakteskipet som i 1868 gikk ned ute ved Steinholmen med en hemmelig last om bord. Som i de andre CLUE-bøkene har også denne historien et filosofisk bakteppe. Cecilie, Leo og Une må gjøre seg kjent med Platons menneskesyn og velge om de skal stole på fornuften eller følge følelsene for å løse Esmeraldagåten.