En ung psykologistudent blir interessert i gamle behandlingsmetoder, metoder vi i dag ville ansett som tortur. Som barn vokste han opp i et strengt religiøst hjem og lærte at sjelen er det viktigste å bevare. Og i en bok leser han om kirurgi for sjelen. En ung politimann jobber på savnetgruppa i Oslo. Han tror alltid at de han leter etter har blitt utsatt for noe kriminelt. Når en ung jente blir borte, er det ingen som tror på ham. Hun studerte psykologi på universitetet. En tidligere soldat forsøker å forstå hvorfor han ikke lenger kunne drepe. Han skriver en oppgave om menneskelig ondskap. Når kjæresten hans plutselig forsvinner, starter han sin egen krig. Han må forfølge fienden fra Oslo til Rio de Janeiro. Lobotomisten er en reise i psykiatriens historie. Inn i menneskers mørke sinn. Gjennom verdens ondskap.