Mary Bowsers hemmeligheter er basert på en sann fortelling, og er en inspirerende roman om en modig kvinnes vilje til å ofre sin egen frihet for å endre historien. Hele livet har Mary Bowser vært slave hos den velstående familien Van Lew i Richmond, Virginia. Men når Bet, den viljesterke datteren i huset, bestemmer seg for å sende Mary til Philadelphia slik at hun kan få seg en utdannelse, må Mary gripe sjansen og forlate sin familie for et liv i frihet. Livet i nord fører med seg nye vennskap, et kjæresteforhold og helt andre studier enn Mary noen gang forventet seg og som bringer henne inn i bevegelsen for avskaffelse av slaveriet. Mens nasjonen står på randen av borgerkrig, bryter hun Virginias lover ved å returnere til Richmond for å ta vare på sin syke far - og for frigjøringskampen. Under dekke av å være slave begynner hun å arbeide i huset til konføderasjonens president, Jefferson Davis. Sammen med Bet risikerer hun livet for å smugle ut informasjon til unionistene. Hun står hele tiden i fare for å bli avslørt, og fører også dem som står henne nærmest bak lyset, for å tjene saken. Når det ser ut til at alt arbeidet hennes ser ut til å lykkes, oppdager Mary at alt har sin pris - til og med friheten.